分子科学与应用化学研究所以揭示分子微尺度结构与物质靶向功能调控的新规律和新效应为引导，以发展新型功能材料与开拓创新性应用为驱动，服务于国家基础性、前瞻性和战略性的重大需求。研究所致力于解决分子微尺度结构、绿色可控合成、材料构效关系与性能调控、脆弱性文化遗产保护、医药与催化领域应用等关键科学问题的研究。在国家重点研发计划项目、国家基础研究计划“973”、国家科技支撑计划、国家自然科学基金项目等的支持下，构建了具有国际一流影响的分子科学与应用化学研究体系。
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